বিশ্বব্যাপী শিশুদের সুস্বাস্থ্য নিশ্চিতকরণে উদ্দীপকে ইঙ্গিতকৃত ইউনিসেফের বহুমুখী কার্যক্রম রয়েছে।শিশুদের সুস্বাস্থ্য নিয়ে ইউনিসেফের একটি কর্মসূচি হলো স্বাস্থ্য সুরক্ষা। শিশু ও প্রসূতি মৃত্যুহার রোধ ও তাদের অবস্থার উন্নতি এবং সংক্রামক ব্যাধির নিয়ন্ত্রণসহ সার্বিক স্বাস্থ্যকর পরিবেশ সৃষ্টিতে কাজ করে। যেমন- বিশুদ্ধ পানি সরবরাহ, বিনামূল্যে নলকূপ স্থাপন, সুষ্ঠু স্যানিটেশন ব্যবস্থা, মাতৃমঙ্গল ও শিশুকল্যাণ কেন্দ্র স্থাপন. সংক্রামক ব্যাধি নির্মূলে টিকা সরবরাহ এবং স্বাস্থ্য সচেতনতা সৃষ্টিতে প্রচারকার্য পরিচালনা প্রভৃতি। আবার পুষ্টির উন্নয়নের জন্য ইউনিসেফ সরকারের সাথে কাজ করছে। যেমন- পুষ্টি বিষয়ে জরিপ পরিচালনা, পুষ্টিকর খাদ্য উৎপাদন, সচেতনতা তৈরি প্রভৃতি। শিশুদের স্বাস্থ্য বিষয়ে সচেতন করতে মীনা ইনিশিয়েটিভ গ্রহণ করা হয়েছে। এছাড়াও আর্সেনিক মোকাবিলায় উদ্যোগের 'পাশাপাশি এইচআইভি/ এইডস বিষয়ে সচেতনতা সৃষ্টিতে কাজ করে। শিশুশ্রম প্রতিরোধ, শিশুর অধিকার প্রতিষ্ঠার লক্ষ্যেও কাজ করে ইউনিসেফ। এছাড়াও বিভিন্ন প্রকাশনার দ্বারা প্রারম্ভিক স্বাস্থ্যসেবা, হাত ধোয়া, বিশ্ব শিশুপরিস্থিতি, শিশু সুরক্ষা প্রভৃতি বিষয়ে সকলের সামনে তুলে ধরে। মোটকথা, বিশ্বব্যাপী শিশুদের সুস্বাস্থ্য নিশ্চিতকরণে ইউনিসেফ ব্যাপক কার্যক্রম পরিচালনা করে